大正12年に建設された洋風木造駅舎の耐震補強を行うとともに全面リニューアルを行い、可能な限り開業当時の姿に復元したほか、平成29年4月の観光列車運行に合わせて、琴平駅舎内に観光列車専用待合室を整備することにより、「こんぴら参り」や観光列車に乗車されるお客様をお迎えするのに相応しい駅舎とした。